Estonya Kırmızısı sığırları, yerli Estonya sığırlarının Angler ve Danimarka Kırmızısı ırkları ile sürekli melezlenmesi sonucu gelişmiştir. Bu melezleme 1800'lerin ortalarında başlamış, yüksek yağ içeriğine sahip süt üreten ve verimi artıran bir ırk yaratmayı amaçlamıştır. Zamanla ağırlık ve vücut büyüklüğünün geliştirilmesine önem verilmiştir. İlk Estonya Kırmızısı hayvanlar 1885 yılında sürü defterine kaydedilmiştir.

I. ve II. Dünya Savaşları sırasında pek çok sürüde kayıplar yaşanmasına rağmen, 19. yüzyılın sonlarında bu cins Estonya'da yayılmaya başlamıştır. 1916'da 269.000 inek olan nüfus 1920'de 225.000'e düşmüştür. Irkın güçlü bir savunucusu olan Jaan Mägi, ırkın gelişimini desteklemek için 1919 yılında Estonya Fener Yetiştiricileri Derneği'ni kurdu. 1928'de ırkın adını Estonya Kırmızısı olarak değiştirdi ve o zamandan beri popülerlik kazanmaya devam ediyor.

Avrupa Kırmızı Süt Irkları Birliği, 1993 yılında Danimarka'da kırmızı ırkları daha iyi ekonomik canlılık için geliştirmek, yetiştiricilere fırsatlar sağlamak ve Avrupa Kırmızı sığır yetiştiricileri arasındaki iletişimi kolaylaştırmak amacıyla kurulmuştur ve Estonya Kırmızısı tanınan beş ırktan biridir. Geçtiğimiz on yıl boyunca, Estonya Kırmızısını geliştirmek için Angler, Danimarka Kırmızısı, İsviçre Kırmızısı, Kırmızı Holstein, Norveç Kırmızısı, Ayrshire ve İsveç Kırmızısı ve Beyazı dahil olmak üzere yedi farklı ırk kullanılmıştır. Irk artık rekabetçi statüsünü tamamen geri kazanmıştır ve Estonya'daki tüm sığırların 63.3%'sini oluşturmaktadır.

Estonya Kırmızısı sığırlar orta büyüklükte ve güçlü bir yapıya sahiptir. Tüy renkleri açıktan koyu kırmızıya kadar değişir ve boğalar tipik olarak daha koyudur. Temel vücut ölçüleri arasında 127,5 cm cidago yüksekliği, 70 cm göğüs derinliği, 45,5 cm göğüs genişliği, 157,9 cm eğik vücut uzunluğu, 195,6 cm kalp çevresi ve 18,3 cm top kemiği çevresi bulunur. Olgun inekler 450 ila 550 kg arasında, en fazla 780 kg ağırlığa sahipken, olgun boğalar tipik olarak 800 ila 900 kg ağırlığındadır ve en fazla 1000 kg civarındadır. Yeni doğan buzağıların ağırlığı 31 ila 33 kg arasındadır.

Değerlendirilen 164.900 inek için ortalama süt verimi 3.92% yağ içeriği ile 3.456 kg'dır. 77 yetiştirme çiftliğinde, Estonya Kırmızı sığırları inek başına ortalama 3.784 kg süt verimi gösterirken, yağ içeriği 3.98% ve protein içeriği 3.30%'dir. Yüksek verimli 12 sürüde, 305 günlük laktasyon süresince ortalama süt verimi 4.127 ila 5.029 kg arasında değişmekte olup, yağ içeriği 3.90% ile 4.18% arasındadır. Bu sürülerdeki rekor sahipleri şunlardır: inek 5338 (5. laktasyon, 9.610 kg süt, 4.14% yağ), inek 4519 (7. laktasyon, 8.554 kg süt, 4.47% yağ) ve inek 2431 (2. laktasyon, 7.806 kg süt, 4.65% yağ).

Estonya Kırmızısı ırkının ıslahı hem saf yetiştirme hem de Danimarka Kırmızısı ve Angler sığırlarıyla melezleme yoluyla sürdürülmektedir. Angler kanı taşıyan yeni türün 4.0% yağ ile en az 7.000 kg süt verimi, dakikada 1.9 kg sağım hızı, 600 kg'ın üzerinde canlı ağırlık ve en az 140 cm cidago yüksekliği elde etmesi beklenmektedir.